Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms