Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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