Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1S2

C3orf33, Protein C3orf33, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf33Q6P1S2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf33Q6P1S2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf33Q6P1S2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf33Q6P1S2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf33Q6P1S2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf33Q6P1S2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf33Q6P1S2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C3orf33Q6P1S2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf33Q6P1S2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf33Q6P1S2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf33Q6P1S2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf33Q6P1S2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C3orf33Q6P1S2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf33Q6P1S2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C3orf33Q6P1S2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C3orf33Q6P1S2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf33Q6P1S2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf33Q6P1S2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf33Q6P1S2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf33Q6P1S2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf33Q6P1S2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C3orf33Q6P1S2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf33Q6P1S2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf33Q6P1S2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf33Q6P1S2 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf33Q6P1S2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf33Q6P1S2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf33Q6P1S2 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf33Q6P1S2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf33Q6P1S2 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf33Q6P1S2 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf33Q6P1S2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf33Q6P1S2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf33Q6P1S2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf33Q6P1S2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf33Q6P1S2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms