Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF123Q5XPI4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms