Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms