Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 GACAT2-201ENST00000579368 818 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms