Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms