Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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