Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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