Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOFQ13790 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOFQ13790 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOFQ13790 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOFQ13790 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOFQ13790 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOFQ13790 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOFQ13790 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOFQ13790 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOFQ13790 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOFQ13790 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOFQ13790 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOFQ13790 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOFQ13790 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOFQ13790 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOFQ13790 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOFQ13790 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOFQ13790 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APOFQ13790 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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APOFQ13790 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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APOFQ13790 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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APOFQ13790 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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APOFQ13790 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOFQ13790 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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APOFQ13790 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOFQ13790 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOFQ13790 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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APOFQ13790 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOFQ13790 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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APOFQ13790 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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APOFQ13790 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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APOFQ13790 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOFQ13790 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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APOFQ13790 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOFQ13790 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOFQ13790 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOFQ13790 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOFQ13790 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOFQ13790 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOFQ13790 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOFQ13790 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOFQ13790 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOFQ13790 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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