Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
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