Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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