Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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SCGB2A2Q13296 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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SCGB2A2Q13296 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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SCGB2A2Q13296 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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