Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CBX3Q13185 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CBX3Q13185 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CBX3Q13185 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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