Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC10A2Q12908 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms