Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC173Q0VFZ6 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC173Q0VFZ6 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC173Q0VFZ6 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC173Q0VFZ6 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC173Q0VFZ6 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC173Q0VFZ6 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC173Q0VFZ6 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC173Q0VFZ6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC173Q0VFZ6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC173Q0VFZ6 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC173Q0VFZ6 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC173Q0VFZ6 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC173Q0VFZ6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC173Q0VFZ6 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC173Q0VFZ6 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC173Q0VFZ6 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC173Q0VFZ6 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC173Q0VFZ6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC173Q0VFZ6 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC173Q0VFZ6 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC173Q0VFZ6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC173Q0VFZ6 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC173Q0VFZ6 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC173Q0VFZ6 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC173Q0VFZ6 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC173Q0VFZ6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC173Q0VFZ6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC173Q0VFZ6 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC173Q0VFZ6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC173Q0VFZ6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC173Q0VFZ6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC173Q0VFZ6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC173Q0VFZ6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC173Q0VFZ6 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC173Q0VFZ6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC173Q0VFZ6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC173Q0VFZ6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC173Q0VFZ6 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC173Q0VFZ6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC173Q0VFZ6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC173Q0VFZ6 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC173Q0VFZ6 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC173Q0VFZ6 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC173Q0VFZ6 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms