Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.05■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms