Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM27E3Q08E93 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms