Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms