Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms