Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms