Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms