Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms