Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERCC6Q03468 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERCC6Q03468 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ERCC6Q03468 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ERCC6Q03468 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ERCC6Q03468 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ERCC6Q03468 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERCC6Q03468 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ERCC6Q03468 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERCC6Q03468 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERCC6Q03468 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ERCC6Q03468 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERCC6Q03468 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERCC6Q03468 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERCC6Q03468 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ERCC6Q03468 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERCC6Q03468 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ERCC6Q03468 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
ERCC6Q03468 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ERCC6Q03468 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ERCC6Q03468 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ERCC6Q03468 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ERCC6Q03468 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ERCC6Q03468 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ERCC6Q03468 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERCC6Q03468 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ERCC6Q03468 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ERCC6Q03468 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ERCC6Q03468 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERCC6Q03468 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ERCC6Q03468 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERCC6Q03468 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ERCC6Q03468 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERCC6Q03468 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ERCC6Q03468 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERCC6Q03468 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
ERCC6Q03468 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ERCC6Q03468 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERCC6Q03468 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ERCC6Q03468 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ERCC6Q03468 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ERCC6Q03468 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ERCC6Q03468 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ERCC6Q03468 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ERCC6Q03468 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ERCC6Q03468 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERCC6Q03468 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERCC6Q03468 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ERCC6Q03468 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERCC6Q03468 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ERCC6Q03468 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ERCC6Q03468 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC27.55■■■□□ 2
ERCC6Q03468 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ERCC6Q03468 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ERCC6Q03468 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ERCC6Q03468 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ERCC6Q03468 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ERCC6Q03468 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ERCC6Q03468 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
ERCC6Q03468 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ERCC6Q03468 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ERCC6Q03468 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ERCC6Q03468 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ERCC6Q03468 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ERCC6Q03468 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ERCC6Q03468 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ERCC6Q03468 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ERCC6Q03468 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ERCC6Q03468 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ERCC6Q03468 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ERCC6Q03468 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ERCC6Q03468 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ERCC6Q03468 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ERCC6Q03468 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ERCC6Q03468 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ERCC6Q03468 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ERCC6Q03468 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ERCC6Q03468 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
ERCC6Q03468 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ERCC6Q03468 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ERCC6Q03468 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms