Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 245.3 ms