Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTBN1Q01082 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms