Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD3P84022 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms