Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23BP54727 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms