Protein–RNA interactions for Protein: P41271

NBL1, Neuroblastoma suppressor of tumorigenicity 1, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBL1P41271 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NBL1P41271 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NBL1P41271 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NBL1P41271 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NBL1P41271 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NBL1P41271 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NBL1P41271 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NBL1P41271 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NBL1P41271 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NBL1P41271 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NBL1P41271 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NBL1P41271 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NBL1P41271 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NBL1P41271 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NBL1P41271 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NBL1P41271 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NBL1P41271 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NBL1P41271 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NBL1P41271 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NBL1P41271 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NBL1P41271 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NBL1P41271 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NBL1P41271 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NBL1P41271 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NBL1P41271 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NBL1P41271 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NBL1P41271 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NBL1P41271 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NBL1P41271 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NBL1P41271 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NBL1P41271 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NBL1P41271 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NBL1P41271 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NBL1P41271 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NBL1P41271 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NBL1P41271 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NBL1P41271 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NBL1P41271 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NBL1P41271 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NBL1P41271 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NBL1P41271 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NBL1P41271 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NBL1P41271 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NBL1P41271 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NBL1P41271 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NBL1P41271 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NBL1P41271 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NBL1P41271 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NBL1P41271 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NBL1P41271 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NBL1P41271 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NBL1P41271 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NBL1P41271 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NBL1P41271 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NBL1P41271 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NBL1P41271 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NBL1P41271 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NBL1P41271 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NBL1P41271 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NBL1P41271 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NBL1P41271 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NBL1P41271 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NBL1P41271 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NBL1P41271 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NBL1P41271 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NBL1P41271 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NBL1P41271 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NBL1P41271 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NBL1P41271 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NBL1P41271 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NBL1P41271 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NBL1P41271 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NBL1P41271 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NBL1P41271 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NBL1P41271 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NBL1P41271 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NBL1P41271 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NBL1P41271 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NBL1P41271 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NBL1P41271 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NBL1P41271 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NBL1P41271 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NBL1P41271 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NBL1P41271 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NBL1P41271 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NBL1P41271 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NBL1P41271 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NBL1P41271 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NBL1P41271 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NBL1P41271 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NBL1P41271 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NBL1P41271 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NBL1P41271 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NBL1P41271 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NBL1P41271 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NBL1P41271 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NBL1P41271 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NBL1P41271 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NBL1P41271 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NBL1P41271 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms