Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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