Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms