Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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