Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD46P15529 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD46P15529 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD46P15529 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD46P15529 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD46P15529 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD46P15529 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD46P15529 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD46P15529 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD46P15529 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD46P15529 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD46P15529 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD46P15529 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD46P15529 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD46P15529 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD46P15529 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD46P15529 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD46P15529 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CD46P15529 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CD46P15529 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CD46P15529 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CD46P15529 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CD46P15529 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD46P15529 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CD46P15529 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD46P15529 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD46P15529 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CD46P15529 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CD46P15529 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD46P15529 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CD46P15529 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD46P15529 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD46P15529 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD46P15529 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CD46P15529 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD46P15529 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CD46P15529 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD46P15529 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD46P15529 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD46P15529 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD46P15529 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD46P15529 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CD46P15529 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD46P15529 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD46P15529 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD46P15529 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD46P15529 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
CD46P15529 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CD46P15529 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CD46P15529 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD46P15529 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD46P15529 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CD46P15529 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CD46P15529 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD46P15529 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms