Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PRF1P14222 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PRF1P14222 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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PRF1P14222 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PRF1P14222 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PRF1P14222 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PRF1P14222 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRF1P14222 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRF1P14222 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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PRF1P14222 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRF1P14222 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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PRF1P14222 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRF1P14222 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRF1P14222 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PRF1P14222 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRF1P14222 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRF1P14222 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRF1P14222 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PRF1P14222 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRF1P14222 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRF1P14222 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRF1P14222 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PRF1P14222 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRF1P14222 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRF1P14222 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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