Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC21.33■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC21.33■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms