Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CT47B1P0C2W7 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CT47B1P0C2W7 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CT47B1P0C2W7 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CT47B1P0C2W7 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CT47B1P0C2W7 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CT47B1P0C2W7 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CT47B1P0C2W7 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CT47B1P0C2W7 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CT47B1P0C2W7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CT47B1P0C2W7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CT47B1P0C2W7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CT47B1P0C2W7 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CT47B1P0C2W7 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CT47B1P0C2W7 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CT47B1P0C2W7 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CT47B1P0C2W7 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CT47B1P0C2W7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CT47B1P0C2W7 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CT47B1P0C2W7 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CT47B1P0C2W7 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CT47B1P0C2W7 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CT47B1P0C2W7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CT47B1P0C2W7 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CT47B1P0C2W7 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CT47B1P0C2W7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CT47B1P0C2W7 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CT47B1P0C2W7 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CT47B1P0C2W7 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CT47B1P0C2W7 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CT47B1P0C2W7 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CT47B1P0C2W7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CT47B1P0C2W7 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CT47B1P0C2W7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CT47B1P0C2W7 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms