Protein–RNA interactions for Protein: P08949

NMB, Neuromedin-B, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBP08949 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NMBP08949 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NMBP08949 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NMBP08949 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NMBP08949 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NMBP08949 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NMBP08949 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NMBP08949 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NMBP08949 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NMBP08949 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NMBP08949 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NMBP08949 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NMBP08949 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NMBP08949 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NMBP08949 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NMBP08949 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NMBP08949 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NMBP08949 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NMBP08949 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NMBP08949 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NMBP08949 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NMBP08949 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NMBP08949 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NMBP08949 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NMBP08949 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NMBP08949 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NMBP08949 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NMBP08949 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NMBP08949 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NMBP08949 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NMBP08949 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NMBP08949 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NMBP08949 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NMBP08949 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NMBP08949 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NMBP08949 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NMBP08949 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NMBP08949 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NMBP08949 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NMBP08949 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NMBP08949 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NMBP08949 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NMBP08949 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NMBP08949 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms