Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SERPINA1P01009 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms