Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms