Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG7O95352 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG7O95352 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG7O95352 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG7O95352 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG7O95352 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG7O95352 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG7O95352 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG7O95352 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG7O95352 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG7O95352 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG7O95352 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG7O95352 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG7O95352 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG7O95352 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG7O95352 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG7O95352 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG7O95352 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG7O95352 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG7O95352 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG7O95352 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG7O95352 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG7O95352 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG7O95352 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG7O95352 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG7O95352 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG7O95352 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG7O95352 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG7O95352 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG7O95352 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG7O95352 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG7O95352 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG7O95352 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG7O95352 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG7O95352 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG7O95352 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG7O95352 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG7O95352 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG7O95352 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG7O95352 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG7O95352 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG7O95352 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG7O95352 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG7O95352 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG7O95352 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG7O95352 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG7O95352 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG7O95352 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG7O95352 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG7O95352 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG7O95352 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG7O95352 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG7O95352 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG7O95352 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG7O95352 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG7O95352 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG7O95352 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG7O95352 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG7O95352 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG7O95352 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG7O95352 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG7O95352 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG7O95352 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG7O95352 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG7O95352 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG7O95352 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG7O95352 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG7O95352 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG7O95352 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG7O95352 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG7O95352 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG7O95352 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG7O95352 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG7O95352 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG7O95352 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG7O95352 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG7O95352 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG7O95352 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms