Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRMUO75648 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRMUO75648 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRMUO75648 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRMUO75648 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRMUO75648 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMUO75648 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMUO75648 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMUO75648 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMUO75648 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMUO75648 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMUO75648 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMUO75648 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMUO75648 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMUO75648 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMUO75648 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMUO75648 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMUO75648 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMUO75648 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMUO75648 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMUO75648 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMUO75648 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMUO75648 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMUO75648 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMUO75648 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMUO75648 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMUO75648 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMUO75648 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMUO75648 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMUO75648 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMUO75648 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMUO75648 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMUO75648 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMUO75648 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMUO75648 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMUO75648 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMUO75648 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMUO75648 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMUO75648 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMUO75648 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMUO75648 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMUO75648 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMUO75648 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMUO75648 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMUO75648 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMUO75648 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMUO75648 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMUO75648 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMUO75648 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRMUO75648 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRMUO75648 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRMUO75648 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRMUO75648 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRMUO75648 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRMUO75648 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRMUO75648 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms