Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB3O43889 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB3O43889 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB3O43889 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB3O43889 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB3O43889 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB3O43889 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB3O43889 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB3O43889 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB3O43889 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB3O43889 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB3O43889 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB3O43889 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB3O43889 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB3O43889 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB3O43889 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB3O43889 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB3O43889 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB3O43889 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB3O43889 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB3O43889 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB3O43889 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB3O43889 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB3O43889 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB3O43889 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB3O43889 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB3O43889 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB3O43889 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB3O43889 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB3O43889 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB3O43889 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB3O43889 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB3O43889 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB3O43889 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB3O43889 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB3O43889 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB3O43889 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB3O43889 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB3O43889 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB3O43889 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB3O43889 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB3O43889 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB3O43889 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB3O43889 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB3O43889 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB3O43889 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB3O43889 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB3O43889 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB3O43889 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB3O43889 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB3O43889 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB3O43889 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB3O43889 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB3O43889 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB3O43889 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB3O43889 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms