Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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HOXA3O43365 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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HOXA3O43365 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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HOXA3O43365 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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HOXA3O43365 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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HOXA3O43365 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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HOXA3O43365 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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HOXA3O43365 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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HOXA3O43365 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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