Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCAO15360 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCAO15360 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCAO15360 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCAO15360 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCAO15360 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCAO15360 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCAO15360 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCAO15360 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCAO15360 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCAO15360 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCAO15360 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCAO15360 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCAO15360 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCAO15360 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCAO15360 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCAO15360 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCAO15360 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCAO15360 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCAO15360 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCAO15360 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCAO15360 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCAO15360 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCAO15360 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCAO15360 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCAO15360 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCAO15360 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCAO15360 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCAO15360 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCAO15360 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCAO15360 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCAO15360 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCAO15360 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCAO15360 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCAO15360 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCAO15360 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCAO15360 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCAO15360 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCAO15360 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCAO15360 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCAO15360 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCAO15360 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCAO15360 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCAO15360 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCAO15360 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCAO15360 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCAO15360 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCAO15360 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCAO15360 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCAO15360 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCAO15360 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCAO15360 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCAO15360 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCAO15360 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCAO15360 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCAO15360 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCAO15360 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCAO15360 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCAO15360 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCAO15360 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCAO15360 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCAO15360 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCAO15360 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCAO15360 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCAO15360 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCAO15360 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCAO15360 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCAO15360 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCAO15360 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCAO15360 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCAO15360 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCAO15360 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FANCAO15360 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FANCAO15360 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FANCAO15360 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FANCAO15360 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FANCAO15360 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FANCAO15360 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FANCAO15360 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FANCAO15360 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
FANCAO15360 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FANCAO15360 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FANCAO15360 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCAO15360 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCAO15360 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCAO15360 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCAO15360 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCAO15360 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCAO15360 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCAO15360 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCAO15360 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCAO15360 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCAO15360 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCAO15360 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCAO15360 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCAO15360 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCAO15360 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCAO15360 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCAO15360 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCAO15360 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms