Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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