Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC10.71□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.71□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC10.71□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms