Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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HDGFL3Q9Y3E1 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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HDGFL3Q9Y3E1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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HDGFL3Q9Y3E1 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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HDGFL3Q9Y3E1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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HDGFL3Q9Y3E1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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HDGFL3Q9Y3E1 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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HDGFL3Q9Y3E1 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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