Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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RABGEF1Q9UJ41 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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RABGEF1Q9UJ41 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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RABGEF1Q9UJ41 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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RABGEF1Q9UJ41 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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RABGEF1Q9UJ41 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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RABGEF1Q9UJ41 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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RABGEF1Q9UJ41 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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