Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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CPNE7Q9UBL6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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CPNE7Q9UBL6 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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CPNE7Q9UBL6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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CPNE7Q9UBL6 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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CPNE7Q9UBL6 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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CPNE7Q9UBL6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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CPNE7Q9UBL6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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CPNE7Q9UBL6 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CPNE7Q9UBL6 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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