Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms